По-голямата част от патогенните микроорганизми в питейната вода се отстраняват чрез методите за пречистване на вода, като коагулация, флокулация, утаяване и филтрация. Дезинфекция се прилага като краен етап от пречистването за подобряване на безопасността на питейната вода.
Дезинфекцията безспорно има значение за доставянето на безопасна вода за питейни нужди. Под деизнфекция на водата се разбира отстраняването, дезактивирането или убиването на патогенните микроорганизми. При този процес микроорганизмите се унищожават или дезактивират, при което се преустановяват техният растеж и възпроизвеждане. Ако микробите не бъдат отстранени от питейната вода, тя ще предизвика болести у хората. Дезинфекцията е процес, близък до стерилизирането, и по време на нея се убививат всички присъстващи микроорганзими, както вредните, така и безвредните. Може да се осъществява чрез физична или химична дезинфекция. Дезинфектантите отстраняват от водата и органичните замърсявания, които се използват от микроорганизмите за хранителни вещества или убежища. Трябва не само да убиват микроорганизмите, но и да имат остатъчно действие, което означава, че следва да запазват активността си във водата след дезинфекцията. Трябва да предотвратяват растежа на патогенни микроорганизми в тръбопроводите след дезинфекция, като водят до деконтаминация на водата.
За химична дезинфекция на вода се използват следните дезинфектанти:
За физична дезинфекция на вода се прилагат, както следва: